惠甜 , 沈兵琪 , 王连春 ^* , 卜晓真 , 邓浪 , 包昌艳 , 周凡 , 李辰晖

1 西南林业大学林学院, 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室, 昆明, 650224; 2 西南林业大学, 西南山地森林资源保育与利用省部 共建教育部重点实验室, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日    发表日期: 2019年12月14日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

本研究旨在鉴定桑树 bHLH 基因，并分析预测其理化性质和保守结构域，以期为研究 bHLH 转录因子在桑树的生长发育、抗逆胁迫以及信号转导过程中的作用提供参考。本研究使用桑树全基因组数据，通过生物信息学方法对桑树的 bHLH 转录因子进行了鉴定与系统分析。结果表明，在桑树全基因组中共鉴定出 173 个 bHLH 转录因子，经过系统进化分析，将其分为四个进化大组，11 个亚组；bHLH 转录因子间理化性质差别和跨度较大，59.1%的等电点小于 7，呈弱酸性；保守结构域分析表明，bHLH 转录因子有两个高度保守的结构域并含有 H5-E9-R13 保守序列，N 端的碱性氨基酸区与 DNA 结合位点有关，C 端的 HLH 区形成螺旋 - 环 - 螺旋结构并且与形成二聚体有关，共含有 5 种保守元件；保守元件分析表明，bHLH 基因家族只含有一个 HLH 保守结构域结构；蛋白互作分析结果表明，相似的功能或者相近的生理过程可能由不同的蛋白控制。鉴定和分析桑树 bHLH 转录因子家族，既可以为桑树的抗旱、胁迫等方面的研究提供分子生物学理论基础，又可以为分子改良桑树品种提供理论依据，从而改良桑椹的果实品质，进一步提高桑椹的食用价值和药用价值。

桑树(Morus notabilis；bHLH 转录因子；生物信息学分析； 全基因组鉴定； 蛋白质互作